La Asamblea FIO constituye la máxima autoridad de la Federación y estará integrado por todos los titulares de sus instituciones miembros (Artículo 8° del Estatuto)Encontrándose en marco de sus atribuciones las de mayor relevancia e importancia de la federación, entre ellas:
- Establecer los lineamentos generales de las actividades de la Federación,
- Promover gestión coordinada de la FIO,
- Impulsar los procesos de colaboración y cooperación entre sus miembros,
- Emitir las declaraciones y comunicados públicos en patrocinio,
- Defensa y difusión de DDHH,
- Velar por el cumplimiento de los Estatutos de la Federación, facultades y funciones comprendidas en los Artículos 11° y siguientes del Estatuto.